Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA4Q13156 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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