Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKRN3Q13064 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MKRN3Q13064 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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