Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RAB40BQ12829 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RAB40BQ12829 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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RAB40BQ12829 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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