Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NCBP1Q09161 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCBP1Q09161 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms