Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms