Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL9Q07325 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL9Q07325 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL9Q07325 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL9Q07325 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL9Q07325 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL9Q07325 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL9Q07325 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL9Q07325 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL9Q07325 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL9Q07325 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL9Q07325 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL9Q07325 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL9Q07325 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL9Q07325 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms