Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FMODQ06828 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FMODQ06828 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FMODQ06828 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FMODQ06828 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FMODQ06828 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FMODQ06828 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FMODQ06828 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FMODQ06828 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms