Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME1Q06323 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME1Q06323 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms