Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	UMP1	YBR173C	447 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	IML2	YJL082W	2196 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	KAR2	YJL034W	2049 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	HPC2	YBR215W	1878 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SPR6	YER115C	576 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ZRT1	YGL255W	1131 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MAP2	YBL091C	1266 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	FAA3	YIL009W	2085 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ARN1	YHL040C	1884 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	HIR2	YOR038C	2628 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	CDC4	YFL009W	2340 nt		5.34	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SFI1	YLL003W	2841 nt		5.33	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	PRO2	YOR323C	1371 nt		5.33	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	MMS21	YEL019C	804 nt		5.33	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	ISY1	YJR050W	708 nt		5.33	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YLR346C	YLR346C	306 nt		5.33	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	NOP58	YOR310C	1536 nt		5.33	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	PAN1	YIR006C	4443 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	ERG4	YGL012W	1422 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	CLD1	YGR110W	1338 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SUP35	YDR172W	2058 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	CIA2	YHR122W	696 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	URE2	YNL229C	1065 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YPL014W	YPL014W	1146 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	GIP1	YBR045C	1920 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YTA12	YMR089C	2478 nt		5.32	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SPO77	YLR341W	1434 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	UBP9	YER098W	2265 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YGR125W	YGR125W	3111 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	GIP2	YER054C	1647 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	TUB3	YML124C	1338 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YMR196W	YMR196W	3267 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YEL067C	YEL067C	588 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SUT1	YGL162W	900 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YKL023W	YKL023W	834 nt		5.31	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	ALD3	YMR169C	1521 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	ALD2	YMR170C	1521 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	LUC7	YDL087C	786 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SFK1	YKL051W	1062 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	GTR1	YML121W	933 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	GSP2	YOR185C	663 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YOR292C	YOR292C	930 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YPL071C	YPL071C	471 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	CDC28	YBR160W	897 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	GAL4	YPL248C	2646 nt		5.3	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	UBC6	YER100W	753 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	AUA1	YFL010W-A	285 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SKI6	YGR195W	741 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	PCT1	YGR202C	1275 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YNL057W	YNL057W	333 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	PEP4	YPL154C	1218 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	RVB1	YDR190C	1392 nt		5.29	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	SSB2	YNL209W	1842 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	STP4	YDL048C	1473 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	LHP1	YDL051W	828 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	RGS2	YOR107W	930 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YPR109W	YPR109W	885 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	YCL012C	YCL012C	405 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	FRS1	YLR060W	1788 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	MEC3	YLR288C	1425 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	RAD16	YBR114W	2373 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	CLA4	YNL298W	2529 nt		5.28	□□□□□ -1.56
MRD1	Q06106	CBF5	YLR175W	1452 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	GCR2	YNL199C	1605 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	APC1	YNL172W	5247 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YDL012C	YDL012C	324 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	SNM1	YDR478W	597 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	MMS2	YGL087C	414 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	DBR1	YKL149C	1218 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	ACP1	YKL192C	378 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YGP1	YNL160W	1065 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	PCL1	YNL289W	840 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	MVD1	YNR043W	1191 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	CIN5	YOR028C	888 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	ECM23	YPL021W	564 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	FZO1	YBR179C	2568 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	RRB1	YMR131C	1536 nt		5.27	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	IMG2	YCR071C	441 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	RSM10	YDR041W	612 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YGR066C	YGR066C	879 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	SPS19	YNL202W	879 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	snR17b	snR17b	332 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	TIF5	YPR041W	1218 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	REI1	YBR267W	1182 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	PCA1	YBR295W	3651 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	SAP155	YFR040W	3009 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	RTC5	YOR118W	1704 nt		5.26	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	ATG32	YIL146C	1590 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	SDA1	YGR245C	2304 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	MOT2	YER068W	1764 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YAR023C	YAR023C	540 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	MAK3	YPR051W	531 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	CEG1	YGL130W	1380 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	RKM4	YDR257C	1485 nt		5.25	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	DXO1	YDR370C	1329 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YEL028W	YEL028W	462 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	SKI8	YGL213C	1194 nt		5.24	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms