Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCZQ05513 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCZQ05513 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms