Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms