Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 MRPL6YHR147C 645 nt5.53□□□□□ -1.52
SND1Q04007 PGA2YNL149C 390 nt5.53□□□□□ -1.52
SND1Q04007 KTR3YBR205W 1215 nt5.53□□□□□ -1.52
SND1Q04007 PDC1YLR044C 1692 nt5.53□□□□□ -1.52
SND1Q04007 SOG2YOR353C 2376 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 TOS4YLR183C 1470 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 OXP1YKL215C 3861 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 KNH1YDL049C 807 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 DOS2YDR068W 933 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 SLO1YER180C-A 258 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 LSM12YHR121W 564 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 DCD1YHR144C 939 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 DAL3YIR032C 588 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 HOR7YMR251W-A 180 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 MET16YPR167C 786 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 NGR1YBR212W 2019 nt5.52□□□□□ -1.53
SND1Q04007 MTC1YJL123C 1437 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 ADE13YLR359W 1449 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YDR222WYDR222W 1248 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 CDC43YGL155W 1131 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 VMA16YHR026W 642 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YLR049CYLR049C 1287 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 CPA1YOR303W 1236 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YPL114WYPL114W 420 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 FBP26YJL155C 1359 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 ATH1YPR026W 3636 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 HPC2YBR215W 1878 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 NTH2YBR001C 2343 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 APM2YHL019C 1818 nt5.51□□□□□ -1.53
SND1Q04007 RPT4YOR259C 1314 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 HRP1YOL123W 1605 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YGR182CYGR182C 354 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 VPS71YML041C 843 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 SPS4YOR313C 1017 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 UBA1YKL210W 3075 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 TEA1YOR337W 2280 nt5.5□□□□□ -1.53
SND1Q04007 ARN1YHL040C 1884 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 PHO8YDR481C 1701 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 PRO3YER023W 861 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 PEX22YAL055W 543 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 ULA1YPL003W 1389 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 SIA1YOR137C 1869 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 VTC2YFL004W 2487 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 TSL1YML100W 3297 nt5.49□□□□□ -1.53
SND1Q04007 VHS2YIL135C 1311 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 IME4YGL192W 1803 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 MEF2YJL102W 2460 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 SPR28YDR218C 1272 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 CNL1YDR357C 369 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 HRT3YLR097C 1035 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YLR283WYLR283W 945 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 SPO20YMR017W 1194 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 ELA1YNL230C 1140 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 GPM3YOL056W 912 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 TUP1YCR084C 2142 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 PRD1YCL057W 2139 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 BUD8YLR353W 1812 nt5.48□□□□□ -1.53
SND1Q04007 IPI3YNL182C 1668 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YFL064CYFL064C 525 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YGL199CYGL199C 471 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 RPS19BYNL302C 435 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YOR318CYOR318C 306 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 YPR202WYPR202W 717 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 snR32snR32 188 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 MMP1YLL061W 1752 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 RGT1YKL038W 3513 nt5.47□□□□□ -1.53
SND1Q04007 PXA1YPL147W 2613 nt5.46□□□□□ -1.53
SND1Q04007 snR63snR63 255 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 GLO2YDR272W 825 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 ADH4YGL256W 1149 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YHR127WYHR127W 732 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 CDA2YLR308W 939 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YMR082CYMR082C 357 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 TLG2YOL018C 1194 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YSA1YBR111C 696 nt5.46□□□□□ -1.54
SND1Q04007 PWP1YLR196W 1731 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 HPF1YOL155C 2904 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 CST6YIL036W 1764 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 GET3YDL100C 1065 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 GCV1YDR019C 1203 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 MHR1YDR296W 681 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 SFK1YKL051W 1062 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 POM33YLL023C 840 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 ROX3YBL093C 663 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 GPI2YPL076W 843 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 CMR3YPR013C 954 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 SSY5YJL156C 2100 nt5.45□□□□□ -1.54
SND1Q04007 ACS2YLR153C 2052 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 POL12YBL035C 2118 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 FRA2YGL220W 363 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 TDH3YGR192C 999 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 CIR1YGR207C 786 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YIL163CYIL163C 354 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YDC1YPL087W 954 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 SAM4YPL273W 978 nt5.44□□□□□ -1.54
SND1Q04007 STR2YJR130C 1920 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms