Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR3Q03167 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms