Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms