Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIM1P81133 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIM1P81133 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIM1P81133 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIM1P81133 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIM1P81133 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIM1P81133 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIM1P81133 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIM1P81133 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIM1P81133 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIM1P81133 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIM1P81133 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIM1P81133 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms