Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM4P67936 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM4P67936 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM4P67936 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM4P67936 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM4P67936 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM4P67936 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM4P67936 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM4P67936 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM4P67936 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms