Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms