Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVPABLB-1P60509 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms