Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCDC1P59894 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCDC1P59894 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms