Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2DP55273 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2DP55273 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms