Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHBP55084 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHBP55084 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHBP55084 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHBP55084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHBP55084 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHBP55084 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HADHBP55084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HADHBP55084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHBP55084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHBP55084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHBP55084 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHBP55084 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHBP55084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HADHBP55084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms