Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRAP54198 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRAP54198 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRAP54198 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRAP54198 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRAP54198 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRAP54198 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRAP54198 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRAP54198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRAP54198 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRAP54198 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRAP54198 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRAP54198 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRAP54198 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRAP54198 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRAP54198 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRAP54198 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRAP54198 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRAP54198 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRAP54198 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRAP54198 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRAP54198 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRAP54198 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRAP54198 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRAP54198 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRAP54198 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRAP54198 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRAP54198 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRAP54198 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIRAP54198 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIRAP54198 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRAP54198 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRAP54198 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRAP54198 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRAP54198 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRAP54198 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms