Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms