Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG4P49917 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG4P49917 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LIG4P49917 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG4P49917 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIG4P49917 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIG4P49917 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIG4P49917 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIG4P49917 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIG4P49917 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIG4P49917 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG4P49917 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms