Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTBP49356 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTBP49356 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTBP49356 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNTBP49356 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNTBP49356 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNTBP49356 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTBP49356 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTBP49356 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTBP49356 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTBP49356 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTBP49356 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTBP49356 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTBP49356 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTBP49356 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTBP49356 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTBP49356 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTBP49356 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTBP49356 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTBP49356 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTBP49356 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms