Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA4P48058 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms