Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA2P48052 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA2P48052 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA2P48052 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA2P48052 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA2P48052 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA2P48052 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA2P48052 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA2P48052 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA2P48052 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA2P48052 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA2P48052 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA2P48052 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA2P48052 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA2P48052 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA2P48052 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA2P48052 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA2P48052 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms