Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPL28P46779 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPL28P46779 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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