Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDH1P40925 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH1P40925 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH1P40925 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH1P40925 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH1P40925 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH1P40925 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH1P40925 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH1P40925 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH1P40925 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH1P40925 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH1P40925 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH1P40925 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH1P40925 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH1P40925 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH1P40925 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDH1P40925 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH1P40925 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH1P40925 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH1P40925 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH1P40925 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH1P40925 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH1P40925 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH1P40925 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms