Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRS3P32247 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRS3P32247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRS3P32247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRS3P32247 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRS3P32247 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRS3P32247 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRS3P32247 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRS3P32247 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRS3P32247 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRS3P32247 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRS3P32247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRS3P32247 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRS3P32247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRS3P32247 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms