Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR1P32246 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR1P32246 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR1P32246 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR1P32246 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR1P32246 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR1P32246 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR1P32246 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR1P32246 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR1P32246 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR1P32246 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR1P32246 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms