Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD11P31277 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms