Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA7P31268 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms