Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRIP30626 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRIP30626 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRIP30626 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRIP30626 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRIP30626 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRIP30626 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRIP30626 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRIP30626 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRIP30626 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRIP30626 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms