Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIPP30301 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIPP30301 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPP30301 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIPP30301 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIPP30301 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIPP30301 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIPP30301 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIPP30301 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPP30301 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPP30301 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPP30301 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPP30301 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPP30301 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPP30301 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPP30301 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPP30301 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPP30301 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPP30301 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms