Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA1P29973 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms