Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTGFP29279 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTGFP29279 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTGFP29279 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTGFP29279 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTGFP29279 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTGFP29279 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTGFP29279 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTGFP29279 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTGFP29279 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTGFP29279 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTGFP29279 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTGFP29279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTGFP29279 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTGFP29279 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTGFP29279 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTGFP29279 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTGFP29279 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTGFP29279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTGFP29279 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTGFP29279 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTGFP29279 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTGFP29279 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTGFP29279 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTGFP29279 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTGFP29279 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTGFP29279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTGFP29279 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTGFP29279 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTGFP29279 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTGFP29279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTGFP29279 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTGFP29279 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTGFP29279 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms