Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HMGB2P26583 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB2P26583 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms