Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPB42P16452 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPB42P16452 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPB42P16452 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPB42P16452 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPB42P16452 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPB42P16452 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPB42P16452 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPB42P16452 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPB42P16452 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPB42P16452 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPB42P16452 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPB42P16452 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPB42P16452 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPB42P16452 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms