Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT13P13646 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT13P13646 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT13P13646 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT13P13646 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT13P13646 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT13P13646 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT13P13646 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT13P13646 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT13P13646 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT13P13646 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT13P13646 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms