Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MS4A1P11836 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MS4A1P11836 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms