Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRFP11831 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRFP11831 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRFP11831 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRFP11831 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRFP11831 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRFP11831 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRFP11831 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRFP11831 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRFP11831 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRFP11831 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRFP11831 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRFP11831 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRFP11831 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRFP11831 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms