Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV1-8P0DP01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV1-8P0DP01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms