Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP10P09238 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP10P09238 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP10P09238 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP10P09238 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP10P09238 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP10P09238 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP10P09238 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP10P09238 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP10P09238 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP10P09238 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP10P09238 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP10P09238 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP10P09238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP10P09238 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MMP10P09238 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP10P09238 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP10P09238 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP10P09238 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP10P09238 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP10P09238 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP10P09238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP10P09238 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP10P09238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP10P09238 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP10P09238 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP10P09238 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP10P09238 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP10P09238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP10P09238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP10P09238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP10P09238 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP10P09238 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP10P09238 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP10P09238 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP10P09238 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MMP10P09238 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MMP10P09238 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP10P09238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms