Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPAP09012 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms