Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEFMP07197 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEFMP07197 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NEFMP07197 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEFMP07197 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEFMP07197 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEFMP07197 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEFMP07197 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEFMP07197 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEFMP07197 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NEFMP07197 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NEFMP07197 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFMP07197 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFMP07197 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFMP07197 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFMP07197 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEFMP07197 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFMP07197 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFMP07197 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFMP07197 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFMP07197 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEFMP07197 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFMP07197 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEFMP07197 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEFMP07197 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFMP07197 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFMP07197 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFMP07197 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFMP07197 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEFMP07197 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEFMP07197 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEFMP07197 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms