Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYL1P05976 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL1P05976 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL1P05976 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL1P05976 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL1P05976 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL1P05976 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL1P05976 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL1P05976 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL1P05976 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL1P05976 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL1P05976 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL1P05976 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL1P05976 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYL1P05976 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MYL1P05976 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL1P05976 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL1P05976 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL1P05976 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms