Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFIP05156 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFIP05156 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFIP05156 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFIP05156 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFIP05156 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFIP05156 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFIP05156 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFIP05156 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFIP05156 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFIP05156 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFIP05156 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFIP05156 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFIP05156 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFIP05156 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFIP05156 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFIP05156 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFIP05156 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFIP05156 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFIP05156 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFIP05156 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFIP05156 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFIP05156 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFIP05156 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFIP05156 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFIP05156 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFIP05156 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms