Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRM2P04554 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRM2P04554 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRM2P04554 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRM2P04554 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRM2P04554 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRM2P04554 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRM2P04554 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms