Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QAP02745 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1QAP02745 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QAP02745 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QAP02745 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QAP02745 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QAP02745 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QAP02745 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QAP02745 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QAP02745 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QAP02745 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QAP02745 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QAP02745 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QAP02745 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QAP02745 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms